O que indica a altura (comprimento) de um ramo em um dendrograma?

Ramo baixo = menor distância / maior similaridade; ramo alto = maior distância / menor similaridade.

Explicação:
Em um dendrograma a altura dos ramos representa a dissimilaridade entre os elementos: ramos próximos ao eixo horizontal indicam elementos mais semelhantes; ramos elevados indicam agrupamentos menos pareados.

Exemplo:
Considere três amostras A, B, C com matriz de distâncias:
\(D=\begin{pmatrix}0 & 1 & 4\\[4pt]1 & 0 & 5\\[4pt]4 & 5 & 0\end{pmatrix}\)
Como \(d(A,B)=1\) é a menor distância, A e B se unem primeiro por um ramo baixo (alta similaridade). Depois, C se junta a maior altura, indicando menor similaridade com o par A–B.