Em expressões partitivas, com qual elemento o particípio deve concordar?

Com o núcleo da expressão partitiva, obedecendo ao seu gênero e número.

O particípio concorda com o substantivo que funciona como núcleo do sintagma partitivo (por exemplo, parte, metade, porção), e não necessariamente com o termo posposto. Portanto, ajuste o particípio ao gênero e ao número desse núcleo dominante.

Exemplo:
A maior parte dos alunos foi aprovada. (núcleo parte, feminino singular → particípio no feminino singular)

Observação prática:
Os alunos, em sua maioria, foram aprovados. (reformulação que torna o referente plural → particípio no plural)