Como deve ser feita a desinstalação de um programa para também remover suas configurações no Windows?

Resposta

Pelo recurso de desinstalação do Painel de Controle (Programas e Recursos).

Explicação:
Aciona o desinstalador fornecido pelo programa, que remove arquivos e entradas no registro.
Oferece opções de reparar ou confirmar exclusão de configurações e componentes.
É o método mais seguro para reduzir arquivos órfãos.