Flashcard FC702099
Qual ferramenta bioinformática é mais apropriada para análise diferencial de expressão gênica em vacinologia de sistemas?
Imunologia
VUNESP · 2025
Qual ferramenta bioinformática é mais apropriada para análise diferencial de expressão gênica em vacinologia de sistemas?
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Resposta
DESeq2 é a ferramenta mais apropriada para análise diferencial de expressão de RNA-seq em vacinologia de sistemas.• Modelo: assume distribuição binomial negativa, estimando média e dispersão por gene para contagens de RNA-seq.
• Entrada: trabalha com matrizes de contagem bruta e informações de desenho experimental.
• Normalização: utiliza fatores de tamanho para ajustar diferenças de profundidade de sequenciamento.
• Testes: aplica testes estatísticos como Wald ou LRT para comparar condições.
• Shrinkage: fornece estimativas de log2 fold change com encolhimento estabilizador.
• FDR: ajusta p-valores para controle da taxa de falsos descobrimentos por múltiplos testes.
Veja como foi cobrado:
https://flashcardsconcursos.com.br/portal/flashcard/700720
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