Questão FC700720
Em um projeto de vacinologia de sistemas, qual ferramenta bioinformática é mais apropriada para realizar a análise diferencial de expressão gênica?
Imunologia
VUNESP · 2025
Em um projeto de vacinologia de sistemas, qual ferramenta bioinformática é mais apropriada para realizar a análise diferencial de expressão gênica?
- BLAST, para alinhamento de sequências de DNA com bancos de dados genômicos.
- ClustalW, para alinhamento múltiplo de sequências de proteínas.
- PyMOL, para visualização de estruturas proteicas induzidas pela vacina.
- DESeq2, para identificação de genes diferencialmente expressos entre condições experimentais.
- Cytoscape, para análise de redes de interação proteica.
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Gabarito
D
Comentário do professor
DESeq2 é um pacote do R/Bioconductor projetado para identificar genes diferencialmente expressos a partir de dados de RNA-seq. Ele trabalha com matrizes de contagem bruta e informações de desenho experimental, permitindo comparar condições como grupo vacinado e controle.
O modelo central assume distribuição negative binomial, estimando média e dispersão por gene. Exemplo formal: \(K_{ij}\sim\mathrm{NB}(\mu_{ij},\alpha_i)\).
Realiza normalização por fatores de tamanho, estima taxas de variabilidade e aplica testes estatísticos (Wald ou LRT). Produz estimativas de log2 fold change com encolhimento e p-valor ajustado para controle de FDR.
Por essas características, DESeq2 é apropriado em vacinologia de sistemas para identificar genes cuja expressão muda de forma robusta entre condições biológicas com replicatas.
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