O ICMS recuperável deve integrar o custo de aquisição ao calcular a média móvel ponderada?

Não.

Explicação:
O ICMS recuperável não integra o custo de aquisição, portanto ao calcular a média móvel ponderada utiliza‑se o valor das compras líquido do ICMS recuperável, somando‑se esse valor ao custo do estoque inicial, e dividindo pelo total de unidades disponíveis para obter o custo unitário médio.

Exemplo:
Estoque inicial: 10 unidades a \$20 cada => \(10 \times 20 = 200\).
Compra: 40 unidades a \$30, ICMS recuperável 12% => valor bruto \(40 \times 30 = 1.200\), custo da compra = \(1.200 \times (1-0{,}12) = 1.056\).
Custo total disponível = \(200 + 1.056 = 1.256\) para 50 unidades, custo unitário médio = \(1.256 / 50 = 25{,}12\).
Venda: 15 unidades a \$50, ICMS 12% => vendas líquidas = \(15 \times 50 \times (1-0{,}12) = 660\).
CMV = \(15 \times 25{,}12 = 376{,}80\).
Lucro operacional = \(660 - 376{,}80 = 283{,}20\).