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Questão FC444827

O processo de anotação genômica requer o uso de fundamentos de biologia e diversas ferramentas para auxiliar o processo. A esse respeito, julgue o item a seguir. Os programas de al

Genética

CEBRASPE (CESPE) · 2025

O processo de anotação genômica requer o uso de fundamentos de biologia e diversas ferramentas para auxiliar o processo. A esse respeito, julgue o item a seguir.

 

Os programas de alinhamento múltiplo de sequências, como o MUSCLE, CLUSTAL W e MAFFT, fazem uso da estratégia de alinhamento progressivo,em que uma árvore-guia é gerada a partir de todas as combinações de alinhamentos par-a-par, e, posteriormente, alinham-se as duas mais similares de acordo com a pontuação fornecida por uma matriz de substituição selecionável pelo usuário.

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Gabarito

Certo

Comentário do professor

A afirmativa está correta porque descreve a estratégia clássica de alinhamento progressivo. Primeiro realiza-se alinhamentos par-a-par para calcular distâncias entre sequências e construir uma árvore-guia (por exemplo por UPGMA ou neighbor-joining).

Em seguida, o algoritmo alinha iterativamente os dois ramos mais próximos da árvore, avançando até agrupar todas as sequências. Ao alinhar pares ou grupos utiliza-se uma matriz de substituição (como PAM ou BLOSUM para proteínas) combinada com penalidades de gap para pontuar e orientar os alinhamentos.

Programas como MUSCLE, CLUSTAL W e MAFFT seguem esse fluxo básico e costumam incorporar refinamentos iterativos e estratégias de perfil ao alinhar conjuntos já formados, melhorando precisão sem alterar o princípio progressivo descrito.

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