Questão FC445819
Em um estudo comparativo entre uma planta nativa (espécie A) e uma geneticamente modificada a partir da espécie A, com deleção de um único gene, foi realizada uma análise proteômic
Biotecnologia
CEBRASPE (CESPE) · 2025
Em um estudo comparativo entre uma planta nativa (espécie A) e uma geneticamente modificada a partir da espécie A, com deleção de um único gene, foi realizada uma análise proteômica compartiva por LC-MS/MS. O banco de dados utilizado para a identificação de proteínas continha todas as sequências conhecidas da família taxonômica da espécie A.
A partir dessa situação hipotética, julgue o item a seguir.
A quantificação de proteínas no referido estudo depende da comparação da massa molecular da soma dos íons detectados e da massa molecular da proteína presente no banco de dados.
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Gabarito
Errado
Comentário do professor
A afirmação está errada.
Em LC-MS/MS proteômica do tipo bottom-up a proteína é primeiro fragmentada por digestão enzimática (por exemplo, tripsina) e a análise detecta peptídeos, não a proteína intacta. A identificação ocorre por comparação espectral dos espectros de fragmentação com sequências do banco de dados.
A quantificação não se baseia em somar massas de íons e comparar com a massa da proteína do banco. Em geral usa-se a intensidade ou a área do pico do precursor no MS1, ou contagem de espectros (spectral counts), ou sinal de repórteres isotópicos em técnicas marcadas.
Além disso, modificações pós‑traducionais e peptídeos compartilhados entre isoformas impedem a simples comparação de massas. Assim, a quantificação é feita a partir de sinais dos peptídeos detectados e agregada para estimar a proteína. \( \text{abundância} \propto \text{área do pico do precursor} \).
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