Questão FC445859
Um pesquisador está investigando o uso de ferramentas de bioinformática para otimizar a edição genética via CRISPR/Cas9 em células humanas. Ele utiliza dados transcriptômicos (RNA-
Biotecnologia
CEBRASPE (CESPE) · 2025
Um pesquisador está investigando o uso de ferramentas de bioinformática para otimizar a edição genética via CRISPR/Cas9 em células humanas. Ele utiliza dados transcriptômicos (RNA-seq) e simulações de dinâmica molecular para prever off-targets. Além disso, o pesquisador aplica algoritmos de machine learning para modelar a eficiência de guias de RNA (sgRNAs).
Tendo em vista a situação hipotética apresentada, julgue o item a seguir.
O alinhamento de sequências via BLAST é irrelevante para identificar regiões homólogas que possam causar off-targets no CRISPR.
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Gabarito
Errado
Comentário do professor
A afirmativa é errada. O alinhamento por BLAST é uma ferramenta útil para detectar regiões do genoma com similaridade à sequência da guia, o que indica potenciais off-targets por complementaridade parcial com o sgRNA.
Embora não substitua métodos especializados, o BLASTn configurado para sequências curtas permite localizar cópias e sequências parcialmente coincidentes em escala genômica. Isso ajuda a identificar loci que merecem avaliação adicional, especialmente quando combinado com verificação da presença do PAM e consideração do número e da posição de mismatches.
Em resumo, o BLAST é relevante como triagem inicial para encontrar regiões homólogas; no entanto, predições finais exigem ferramentas que integrem mismatches, bulges, PAM e fatores epigenéticos para estimar o risco real de off-target.
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